Modele de afaceri mici
Category : Sem categoria
L`analyse de réseau représente une alternative prometteuse dans de telles circonstances limitées de données [22 – 24]. Comme beaucoup de voies moléculaires dans l`EIA sont qualitativement bien décrites, les réseaux d`interaction peuvent être une approche appropriée pour caractériser l`EIA. Ces réseaux sont des représentations simplifiées des systèmes biologiques dans lesquels les composants du système tels que les gènes, les protéines ou les cellules sont représentés par des noeuds et les interactions entre eux par les arêtes [25]. Les modèles de réseau booléen, initialement introduits par Kauffman [26, 27], représentent les modèles dynamiques discrets les plus simples. Ces modèles supposent seulement deux États discrets pour les noeuds d`un réseau, ON ou OFF, correspondant aux valeurs logiques 1 (actif) ou 0 (non actif, mais pas nécessairement absent) [28]. Un modèle logique bien conçu pourrait générer des résultats prédictifs en raison d`un ensemble de conditions initiales. Des cadres qualitatifs et logiques ont émergé comme des approches pertinentes avec différentes applications, comme en témoigne un nombre croissant de modèles publiés [29]. En complément de ces applications, plusieurs groupes ont fourni diverses méthodes et outils pour soutenir la définition et l`analyse des modèles logiques, comme cela peut être vu par les récentes réalisations du Consortium pour les modèles et outils logiques (CoLoMoTo) dans la logique modélisation [30]. Il existe déjà plusieurs outils pour la modélisation booléenne des réseaux de régulation dans lesquels il est possible de définir des relations directes d`inhibition d`activation entre les composants du réseau, tels que BoolNet R [31] ou GINsim [32]. Plus récemment, le paquet R SPIDDOR (pharmacologie des systèmes pour le développement efficace de médicaments sur R), entre autres, a mis en place de nouveaux types d`interactions et de perturbations réglementaires dans le système, tels que les modulateurs positifs et négatifs et la les altérations du polymorphisme, qui conduisent à une dynamique plus riche entre les noeuds [28]. La maladie inflammatoire de l`intestin (EIA), qui touche environ 1,4 million individus aux États-Unis seuls, est une affection inflammatoire intestinale chronique causée par des conditions multifactorielles chez un hôte génétiquement prédisposé. L`EIA est caractérisée par deux formes majeures, la maladie de Crohn (CD) et la colite ulcéreuse (UC), qui sont médiées par des mécanismes communs et distincts et présentent des caractéristiques cliniques distinctes [1 •, 2, 3].
De nombreux types de souris knockout (KO) et transgéniques développent spontanément une inflammation intestinale [4] et récemment, de nombreux gènes de susceptibilité à l`IBD ont été identifiés chez l`homme [5, 6, 7 • •, 8, 9, 10 •, 11 •, 12 – 15]. Le lien entre les études génétiques humaines et les modèles animaux d`EIA est un trouble multigénétique dont les mécanismes fondamentaux sont encore peu clairs. Comme le montre la figure 2, les données antérieures et actuelles des modèles animaux de l`EIA indiquent que les voies, qui sont identifiées chez les patients atteints d`EIA par le biais d`études d`association génique, lient directement ou indirectement ensemble pour faire un «réseau immunitaire IBD». Par conséquent, les stratégies thérapeutiques ciblant le réseau peuvent être justifiées pour l`EIA. Alternativement, les données issues des modèles animaux suggèrent également que le mécanisme fondamental de l`EIA est beaucoup plus compliqué qu`auparavant et même actuellement prédit. Par exemple, le rôle d`une molécule individuelle dans l`IBD diffère distinctement en fonction de plusieurs facteurs tels que les types de cellules impliqués, les tissus ciblés et les environnements exposés. Par conséquent, une thérapie spécifique à la cellule, spécifique au tissu ou personnalisée, par exemple par l`entremise de bactéries lactiques d`ingénierie [99], de nanoparticules [119], de délivrance de gènes guidant la coloscopie [69 •], ou de systèmes d`administration de la capsule endoscopie-médiation peut être nécessaire pour améliorer la vie des patients atteints d`EIA de manière plus efficace et plus sûre. Le gène NOD2, qui encode un récepteur intracellulaire du dipeptide MURAMYLE (une fraction du peptidoglycan de la paroi cellulaire bactérienne), a le premier facteur de risque génétique définitif identifié pour le CD [5]. Trois modèles de souris différents NOD2 non fonctionnels ont été développés.
Le premier modèle de souris, qui porte une mutation NOD22939insC semblable à la mutation de déphasage NOD23020insC associée au CD humain, est sensible aux lésions intestinales induites par le sulfate de sodium de dextran (DSS) [28].
